Ao marcar o backup na nuvem, iCloud, seja no iOS ou no iTunes, a opção de backup local no iTunes é desabilitado. Sim eu recomendo deixar o backup do iParelho no iCloud. Mas também recomendo ter um backup local.
Uma vantagem extra de deixar o backup na nuvem, o sincronismo com o iTunes fica mais rápido. Já que não precisa efetuar o backup.
Restaurar backup é lento. Ainda mais puxando da nuvem. Melhor fazer a restauração localmente. Só que ficar habilitando e desabilitando o backup no iCloud para fazer localmente o backup é muito trabalhoso e pouco prático.
Para ter mais praticidade, e efetuar o backup local sempre que quiser, acesse o iTunes, clique no seu dispositivo com o botão direito e escolha “Efetuar Backup”.