Para controlar as Apresentações Keynote no Mac através do iOS, existia o Keynote Remote, um app separado.
Sua funcionalidade foi integrada no Keynote 2.1 para iOS, basta tocar no ícone do Controle Remoto.
Lembre-se se ativar o Controle Remoto do Keynote para Mac nas Preferência do Aplicativo.
O Keynote Remote, lançado em 2009 e atualizado pela última em 2011, foi removido da loja.