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A tecnologia 3D Touch é nova e algumas pessoas se atrapalham com o toque longo que ativa a deleção/organização de apps na tela de início.
O ideal claro é fazer menos força na tela. Se você está ativando o 3D Touch sem querer, você está aplicando muita força na tela.
Há quem recomende desabilitar o 3D touch, acho muito bruto. Prefiro sugerir a configuração da sensibilidade do 3D Touch de acordo com o seu toque.
Outra coisa que você pode é usar uma pasta. Já que ao tocar uma pasta não ativa o 3D Touch, não importa se você está fazendo força em demasia ou não.