Antes de tudo, lembre que backup nunca é demais.
Mas o espaço pode estar crítico no seu computador. E você pode ter backup no iCloud…
E outra, não raro aparecem backups antigos, backup que não fazem sentido. Portanto, verifique as Preferências do iTunes -> Dispositivos -> Backup de dispositivos
Outra dica também é apagar os Apps do iTunes. Afinal, eles já estão nos dispositivos. Só salve aqueles Apps especiais que já saíram da Loja.